根据你对自家坐便器的叙述，看来水箱是没问题的，关键是坐便器下部水封和关联管道部分存在疑点。
由于座便器结构非常复杂，生产过程中会有很多眼孔需要处理，处理不当会产生小裂纹，而有些眼孔是与返水弯排污管道相连的，这些裂纹则会直接导致座便器出现漏水问题。
1）坐便器气密度检查。厂家抽真空检查是检查产品的气密度，在一定的气压下，保持一定时间，不透气，则视为合格。在检验过程中，经常发现由于成型工序操作不当造成的漏气问题。漏气则说明有气孔，容易造成封口水的慢渗漏。应该注意：水道内壁一定要挂釉，一些厂家的产品表面釉质还可以，但看不见的内部管道上釉少或釉质粗糙，造成砂眼、气孔，甚至有细裂纹，这也是造成慢渗漏的原因之一。釉质好的坐便器管道无釉裂、坯裂，内壁光滑，污物也不易吸附。
2）坐便器水封高度。高度越高水封越好，一般应该在50mm高度，如果在20~30mm的话，水封高度不足，可能会导致封闭不严，污染室内环境。发达国家对水封的要求特别严格，水封回复的高度是他们每次验货必查的项目，韩国甚至要求水封高度不得低于65mm，而美国也正在把大水封的产品作为一个特色卖点，全力推向市场。由于目前我们国家对流入市场的卫生洁具产品控制不力，有20～30mm水封的产品在市场销售，甚至有直冲式，基本无水封的产品也敢在市场上摆。较好产品的水封回复功能为每次冲洗后深度不小于50mm。
3）坐便器养水试验。除了气密度检查，为保证出厂的产品不漏气，应对产品做养水试验。养水时间最少不能低于12小时，内部有裂纹的产品在养水时间内可以从水封高度的变化显现出来，水封高度变化不大时，则视为合格，如果有较大变化，则说明产品有问题。
4）外力作用。或许，还有一种可能，即：和坐便器连通的外部管道，有时会因为大量水流流动，流速很快，产生吸力，造成自家坐便器虹吸管内少量水封水的平衡被破坏，水被吸走了。这是外力作用，与自家的坐便器无关。
5）附图（以虹吸式为例）