首先需要弄清楚，你房屋的拆迁补偿是以什么为单位的，是以户还是以人头，你没有版交代清楚。不过权看你的意思应该是按户的人头计算的。简单的说，如果不结婚，你能拿到一套房产，这一套房产不管你结不结婚或者离不离婚，都是属于你个人的。现在要考虑的是结婚以后所分的三套房产，这其中由一套是你自己的，那么还剩两套，这两套应该是这么分的：据于婚姻关系，女方分得一套，女方的女儿分得一套。女方女儿分得的一套自然不属于你的了。现在有争议的就是女方分得的这一套。按婚姻法的规定，这一套房产是据于婚姻关系的存续取得的，属于夫妻共同财产。在离婚时一般是一人一半。
关系弄清楚了，现在要讨论的是你与女方的协议问题。以你的情况协议这种东西仅对你们双方有效，在离婚时如果双方没有异议，当然没问题，记得把该过户的房产过户了就可以。问题在于如果女方不同意而起诉至法院，那么，这个协议自然就无效了。法院会按照我上面的分析进行判决。我的意见是，立协议，分女方一套，并且过她的户，另外两套过你的户。赌的是女方不懂法，离婚时协议离婚就可以了，起码不用闹到法院。而你嘛！本来你只能分一套的，现在分两套，哪怕将来起诉到法院了你也还能分一套半，怎么着都赚了。