从性能上对比，水性漆的成分是合成树脂和水性溶剂，木蜡油则集合了数种油和蜡的内优点而成，因此容从渗透性来说木蜡油是最好的，涂刷后木材的纹理得以突显，而其他都有表层漆膜，纹理故而会略显模糊；耐水性耐污性方面，由于目前的水性漆性能还未臻完善，遇水易出现白斑，所以木蜡油的效果是最好的；耐候性方面木蜡油没有漆膜当然比有漆膜的更胜一筹。
从施工角度来讲，木蜡油表干只需2-6小时，实干12-24小时，而水性漆需24-48小时才能干燥，水性漆需5℃以上才能施工，都不如木蜡油来得简便；而且颜色的选择上，木蜡油有几十种现成颜色，并且还可以现场再调色，表现力非常丰富，色彩上也比水性漆来得更为鲜艳，涂布率也比水性漆高上数倍。