一般县级的水务局副局长是副科级，相当于副科长；局长是正科级，版相当于科长权。
根据中共中央组织部1993年9月发布的《关于中国共产党机关参照试行<国家公务员暂行条例>的实施意见》，党的机关工作者的级别划分，参照国家公务员暂行条例执行。
其中科长的职务与级别的对应关系是：科长，县（市、旗、省辖市的区）委各部部长、各局局长，乡（镇）党委书记，县（市、旗、省辖市的区）纪委副书记，主任科员：九至十二级；
副科长的职务与级别的对应关系是：副科长，县（市、旗、省辖市的区）委各部副部长、各局副局长，乡（镇）党委副书记，县（市、旗、省辖市的区）纪委常委，副主任科员：九至十三级；
由上面的对应关系可知，县级的局长是正科级，相当于科长；县级的副局长是副科级，相当于副科长。
故，一般县级的水务局副局长是副科级，相当于副科长；局长是正科级，相当于科长。
参考：
《关于中国共产党机关参照试行<国家公务员暂行条例>的实施意见》中共中央组织部1993年9月