建设园林苗圃要选择交通方便的地方，以便于苗木的出圃和育苗物资的运入内。在城市附容近设置苗圃，交通都相当方便，主要应考虑在运输通道上有无空中障碍或低矮涵洞，如果存在这类问题，必须另选地点。乡村苗圃（苗木基地）距离城市较远，为了方便快捷地运输苗木，应当选择在等级较高的省道或国道附近建设苗圃，过于偏僻和路况不佳，不宜建设园林苗圃。
园林苗圃应建在地势较高的开阔平坦地带，便于机械耕作和灌溉，也有利于排水防涝。圃地坡度一般以1～3°为宜，在南方多雨地区，选择3～5°的缓坡地对排水有利，坡度大小可根据不同地区的具体条件和育苗要求确定。在质地较为粘重的土壤上，坡度可适当大些，在沙性土壤上，坡度可适当小些。如果坡度超过5°，容易造成水土流失，降低土壤肥力。地势低洼、风口、寒流汇集、昼夜温差大等地形，容易产生苗木冻害、风害、日灼等灾害，严重影响苗木生产，不宜选作苗圃地。