预算算量时砖基础上面的水平防潮层是否要扣去柱子所占的面积

参照各地区工程量计算规则。清单计价的话，防潮层是综合在基础内的。
一般来说，工程量计算规则是：“墙基防水、防潮层，外墙按外墙中心线长度、内墙按墙体净长度乘以宽度，以平方米计算”，由此看，是不扣除的。