根据《南通市市区房改房上市交易暂行办法》（通政发〔1998〕号，以下简称“暂行办法”）的规定及其《实施细则》第三条规定房改房上市交易，买卖双方应缴纳下列税费：
（一）卖方应缴纳营业税、城市建设维护税、教育费附加、土地增值税和个人所得税（以下简称“综合税”），统一按房屋成交价（成交价低于评估价的，按评估价计算）5％的综合征收率计缴。卖方缴纳的综合税，由市房改办暂以纳税保证金的形式代收。卖方自交付保证金之日起前
半年或后一年内又购住房的可申请退还保证金，但所购住房款少于出售住房款的，保证金按比例转为综合税上交财政。卖方在规定时限内不再购房的，保证金全额转为综合税上交财政。
（二）买方按4％的税率缴纳契税。为启动房地产二、三级市场，暂按成交价（成交价低于评估价的，按评估价计算）的50％计征。
（三）房改房上市交易后，卖方又购买住房的，其购房成交额等于或低于售房成交额的，可参照房改换购住房有关政策执行，免缴买房契税；新购住房成交额大于售房成交额的差额部分，由购买者按规定缴纳契税。
（四）买卖双方各按成交价（成交价低于评估价的，按评估价计算）的0．5％缴纳房屋买卖交易费（包括房屋面积测定和价格评估、资料审核、产权登记、转移变更等各种费用）。
（五）在计征契税和计缴房屋买卖交易费时，包含在成交额内属于房屋装饰部分的款项作相应扣除。