买复式楼花了2层的钱房产证只有一层半这样是不是很吃亏

一切都应来该按房产证上自写的面积来计算价格。
你的情况是属于被明显的价格欺诈，开发商耍了手腕，把一层半的当二层房来卖，业主多付了四分之一的钱。像这样的情况，除了与开发商交涉以外，还得借助媒体、消协、工商的方面的力量来配合。
一是予以揭露，二是要给以罚款。这不是简单的退款问题。不跟开发商往“价格欺诈”上法院去追究他的责任，他们是不会轻易认账的。

还少交纳契税呢。