都是指通商、通航和通邮
小三通是台湾提的，大三通是中央提的。大三通比小三通更直接更方便更有效。
小三通指：台湾当局在两岸未能事先磋商的情况下于2000年12月13日单方面批准的《试办金门马祖与大陆地区通航实施办法》，俗称“小三通” ，并决定于2001年1月1日开始实施。根据《试办金门马祖与大陆地区通航实施办法》，凡设籍金马地区满6个月以上居民，得申请赴对岸观光、旅游与从事商务活动。而大陆地区人民得经由金马地区亲友或旅行社，申请赴金马地区进行旅游、商务、探亲或探病奔丧；每年将允许一定数量的大陆同胞到金门和马祖访问，最长逗留时间不超过七天；明确规范开放大陆地区物品准许输入金、马两地的项目，并予免关税优惠,但现阶段仍禁止大陆货物经金、马两地转运往台湾地区，违者将依海关缉私条例惩处；
大三通是实现海峡两岸直接“通邮、通航、通商”的简称，最早在1979年全国人大常委会在《告台湾同胞书》中提出，它反映了两岸人民的迫切要求。开辟两岸直达邮路、直达电路，可以满足民众需求，节省经转费用，提高各类邮电服务质量；两岸直接航行，可以为两岸民众提供安全、便捷、经济的交通运输条件，可以进一步扩大人员往来与两岸经济合作，共同发展，共同繁荣。“大三通”即“三通”，是海峡两岸直接“通邮、通商、通航”的简两岸大三通时代的开始称，最早是由全国人大常委会在1979年元旦发表的《告台湾同胞书》中提出的。《告台湾同胞书》倡议海峡两岸应“尽快实现通航、通邮”，“以利双方同胞直接接触，互通讯息，探亲访友，旅游参观”。20多年来，为实现“三通”，祖国大陆做了不懈努力，并提出了“一个中国、直接双向、互惠互利”的基本原则。2008年12月15日，两岸隔绝60年后，两岸海空直航及直接通邮的两岸“大三通”全面启动，台湾大陆真正迈入一日生活圈，宣告两岸大三通时代来临。马英九强调，两岸通航后，台商应积极发展新的经营模式，“交通部次长”游芳来强调，这个世界本来就是一体的，两岸人民透过直航将有密切的互动与往来，将为两岸带来新的机会、新的希望。