小三通是指台湾当局在两岸未能事先磋商的情况下于2000年12月13日单方面批专准的《试办金门马祖与大属陆地区通航实施办法》，俗称“小三通” ，并决定于2001年1月1日开始实施。根据《试办金门马祖与大陆地区通航实施办法》，凡设籍金马地区满6个月以上居民，得申请赴对岸观光、旅游与从事商务活动。而大陆地区人民得经由金马地区亲友或旅行社，申请赴金马地区进行旅游、商务、探亲或探病奔丧；每年将允许一定数量的大陆同胞到金门和马祖访问，最长逗留时间不超过七天；明确规范开放大陆地区物品准许输入金、马两地的项目，并予免关税优惠,但现阶段仍禁止大陆货物经金、马两地转运往台湾地区，违者将依海关缉私条例惩处；“小三通”试办期限为一年。
小三通于2001年1月1日，海峡两岸实施的小型三通模式，实现两岸小规模的通商、通航和通邮。