虹吸式马桶内有一个完整的管道，形状呈侧倒状的“S”，池壁坡度较缓回，噪音问题有所改善；具答有排污能力强，选净面大的特点，所以绝大多数马桶尤其是连体均采用虹吸式。最大优点就是冲水噪音小，也就是所谓的静音。容易冲掉黏附在马桶表面的脏物。缺点是：池底存水面积增大。
直冲式马桶利用被压缩的空气形成的很大的推力，冲水速度快，冲力大，强排污，速度快，用水少，不泄漏。直冲式由于使用的是水流瞬间强大的动能，所以冲击管壁的声音比较大。
不管哪种马桶，首先要取决的是下通的管道，如果管道带有U型存水弯，就选择直冲式的，如果没有存水弯的话，建议选用虹吸式。