学院实行党委领导下的院长负责制。学院现设有党政办公室、宣传统战部、组织人事处、纪检监察（审计）处、教务处、科研处、招生就业处、学生处、计划财务处、后勤管理处、保卫处、工会、团委等13个行政管理机构；15个教学机构（师范学院、美术与传媒学院、经济管理与法学院、计算机信息学院、外国语学院、人文与旅游学院、机电工程学院、铁道学院、建筑工程学院、生物化学工程学院、国际教育学院（外事办）、呼和浩特市广播电视大学、继续教育学院、培训学院、马列部）；3个教学辅助机构（高职高专研究所（项目办）、图书馆、网络管理中心）。
（二）办学规模、层次与专业结构
截至2007年底，学院在校学生9556人。招生专业54个，基本适应了呼和浩特地区不同行业对人才的需求。食品生物技术（乳制品）、应用化工技术（煤化工）专业群等六个专业群被列为学院重点建设的专业群。学院有自治区级品牌专业3个，自治区级精品课程3门。
（三）师资队伍与科学研究
学院现有教师总数为612人，高级职称213人，聘用行业企业兼职教师500人，已基本形成了较稳定的“双师型”教师队伍，具有硕士或以上学历学位的青年教师115人，先后聘请6名外籍专家任教。2004年以来，全院教职工发表学术论文454篇，其中，省部级刊物上发表381篇，主编、参编教材和专著43部。学院主办有《呼和浩特职业学院学报》。
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