这样为什么不能办理烟草证

不符合合理化布局规定。
当时你交了材料，是否给你出具受理通知书或者不予受理通知书呢 ？
如果都没有，那就不符合程序规定。
但是呢，距离不够50M是不符合合理化布局规定的。