工程施工单位如何确认工程结算

材料票据 人工 机械使用 签证单

可以根据工程复竣工决算审计制报告里面确定的审定金额开具工程结算发票，审计报告和工程结算发票一并作为原始凭证。或者只用工程结算发票作为原始凭证，审计报告另行存档保管。
如何确定收到的工程款为哪一合同项目的？

可以与拨款单位沟通，确定每笔拨款属于哪一合同项目的。如果没有要求，对于同一个拨款单位也可以合在一个统一的“应收账款”账户中，不划分属于哪一合同项目的