我单位有很多光盘听说有专门放光盘的柜子――光盘柜实用性怎么样

没有太理解你的意思。
光盘柜还是光盘塔，你是仅仅为了保存还是其他原因（如大量刻录）？

仅仅为了保存无所谓的，集中保存即可，没有必要把。