纳米银和有机硅季铵盐都可以做为抗菌用途。
有机硅季铵盐抗菌剂的最大优点是环保安全版无毒,（美国环权境保护署列为安全物质)，对皮肤无刺激性而且抗菌效果持久，耐洗，抗菌效果也很好。因而在诸如棉，涤纶，锦纶等材质高档织物抗菌防霉上得到广泛应用，如贴身内衣内裤抗菌，毛巾，鞋垫，袜子抗菌；现在在皮肤外用消毒及各种材料防霉除臭上也很有应用前景；缺点是价格较一般普通抗菌剂贵一些。
纳米银的优点是比有机硅季铵盐抗菌效果更好，在国内一些业者目前宣传较多；但是美国等欧美国家是禁止使用纳米银做为抗菌剂使用的，建议可以查询美欧国家相关资料，包含美国环境保护署不环保安全。因为银离子会不断释放出来，国外规定，水体中银的PPM不能超过0.5PPM,否则会造成重金属污染，对水体造成巨大的破坏，虽然古代用银器来鉴别毒性，但纳米银抗菌剂如果被人体内脏吸收，会累积而发生病变，危害人体健康。
唉！我们国家环保安全法规，还差太大距离啊！