首先，装修工程根据规定也是需要办理施工许可证的，划定的范围在后边说。办理了土建工程的专施工许可证，并不属意味着允许你直接装修。时间关系上必须是房屋验收完成了，才能装修，否则质监安监在土建工程验收时会给你好看。我的建议是等土建工程竣工验收后再装修。
我不清楚你所说的建筑的使用性质，是公共建筑还是民居，建议你再说详细点。我先按照公共建筑来说这事。
对于装修工程而言，拿施工许可证不是目的，目的是为了后边办理消防手续。如果你的这栋建筑属于消防检查和重点关注的范畴，就要有施工许可证。而拿施工许可证就必须要去找正规设计、审图，再组织招标，办理质监安监，最后拿施工许可证。拿到施工许可证才能办理消防设计审查（不大于1万平米的装修规模按此程序，KTV、游戏厅例外）以及此后的消防竣工验收。
最后说说目前建设管理部门和消防部门对于装修工程办理手续的最低要求是：大于300平米装修或装修金额大于30万元，要求办理施工许可证和消防设计审核。对照这个标准，你看看有没有达到线。说实话，装修工程的施工许可证比较好拿，如果消防不管，不办都可以，关键看你的使用性质和规模，很多单位也是这样操作的。有问题继续问我。