1、首先一定要找专门的房屋鉴定机构对该房屋质量等级进行鉴定，个回人认为可以在对答方施工建房前，对你的房屋质量进行鉴定，对方施工之后再做个鉴定，看是否有被严重毁损的迹象，不过鉴定费用比较高，你们需好好协商下。
2、至于找公证机构进行公证，只是证明该房屋原有的一个大致情况，并不能证明对方施工之后你的房屋质量会是一个什么情况，但是个人建议你们之间达成的协议可以进行公证，这样对方也难以反悔。
3、对于房屋的准确估计还是找个专业的房屋鉴定部门，可以详细咨询所在地的建筑工程质量监督局，找专业的房屋鉴定机构。