破伤风痉来挛毒素由血液源循环和淋巴系统在体内传播，并附合在血清球蛋白上到达脊髓前角灰质或脑干的运动神经核，到达中枢神经系统后的毒素主要结合在灰质中突触小体膜的神经节甙脂上，使其不能释放抑制性递质（甘氨酸或氨基丁酸），以致α运动神经系统失去正常的抑制性，引起特征性的全身横纹肌的紧张性收缩或阵发性痉挛。毒素也能影响交感神经，导致大汗、血压不稳定和心率增速等,最终导致死亡,另外破伤风杆菌还会产生溶血毒素造成局部坏死和心肌损害,这也是以上血栓发生的原因.发生机化则是机体的一种适应表现,血栓的结局有很大可能是机化再通,至于死因是破伤风痉挛毒素造成的