房屋征来收过程中产生自冻结可能由于政府《房屋征收决定》不合法，经行政诉讼法院认为应当停止执行本期《房屋征收决定》而产生房屋征收冻结，但这种情形一般不会出现，因为在征收决定作出前都经过风险评估，征收合法性都经过审查。
通常冻结是由于产权争议及房屋抵押及当事人债务纠纷，在这种情形下有以下两种做法：
1、对房屋产权争议的可以由当事人向人民法院起诉确权，在确权后再与取得产权的当事人进行房屋征收补偿；由于房屋产权争议在规定期限内往往不能签订房屋补偿协议，通常市人民政府会作出《房屋补偿决定》补偿款或安置房实行冻结，房屋保全拆除，房屋内的住户可以搬迁至政府补偿决定给予产权调换的房屋。
2、如果是房屋抵押纠纷或债务纠纷由人民法院判决后或诉前保全时都可以采用冻结补偿的办法处理。通常这种情况下产权人可以与征收人洽谈补偿安置事宜，可以先搬迁让房享受征收一切待遇或奖项，房屋可以拆除，但补偿款或安置房需法院解除冻结后才能领取。