1915年12月，袁世凯在北京自称“洪宪”皇帝，蔡锷、唐继尧在云南首发护国起义，出兵四川、广西讨袁。当时依附于袁世凯的广西军阀龙济光之兄龙觐光被任命为“云南查办使”，率粤军第一部企图借道广西进攻滇南夹击护国军。朱朝瑛为属下第三路军司令，带领士兵1700余名在广西百色以西被护国军纵队长杨杰率军击败，龙觐光余部也被护国军和桂军歼灭。与此同时，朱朝瑛之子朱映桂联络土司和土匪武装进攻建水城，亦为护国军打败，朱映桂战死。战后，朱家花园被没。直到1922年，唐继尧感念朱家辛亥革命有功，始发还家产。
1927年，唐继尧死后，龙云执掌云南军政大权，他所招抚的绿林武装南防游击军指挥李绍宗部进入个旧。此时，朱朝瑛任个旧、蒙自守备军司令官，命其侄朱映椿等严加防范，后双方火拼七昼夜，烧毁店铺上千间，死数百人，酿成惨祸。事后，省府指令解送朱朝瑛和朱映椿到昆囚禁。后朱映椿被处决。
朱朝瑛本人被保出狱后，朱氏家庭巨额家产被国民政府为公有，诺大的家族作鸟兽散，朱朝瑛也于1930年在穷困不堪和失意潦倒中客死他乡。
朱家的花园自然也就不在属于朱家，朱氏家族终于在一个新旧世界交替的乱世灰飞烟灭了。所幸的是花园留了下来。
解放后，朱家花园被人民政府收为公产，曾作办公用。在“文革”时期，朱家花园被弄得一片混乱，很多不是朱家的人也住在里面，连卖零食的小贩都可以大摇大摆地从大门进去，挨家挨户叫卖，然后又从另外一道门出来。至八十年代末期，房屋门窗、木壁等已完全破损，大量的雕刻、楹联、匾额已不复存在。
1989年，云南省人民政府公布朱家花园为省级重点文物保护单位；1990年被建水县政府收回维修。
1999年，朱家花园列为“99昆明世界园艺博览会”旅游精品景点，对朱家花园重新修缮，并重建了后花园。修旧如旧，让南来北往的游人瞻仰。县旅游部门还利用原建筑房间众多的特点，从二进院的四个院落中增辟了“梅馆”、“兰庭”、“竹园”、“菊园”共28个房间作为客房，供游人入住，亲身体验清代起居生活方式。房间内的床，凳，桌，椅及宫灯赞美均采用紫木雕刻，体现清代风格：门僮及导游小姐的服饰和接待客人的清式礼仪，让人有恍若置身百年前历史生活的感受：游清代民宅，园红楼幽梦――此举颇受中外游人的欢迎。
历经百年沧桑的朱家花园又焕发了勃勃生机。
据说，当年修复好以后请关健华（朱映楷的侄女）回到朱家，她说现在修建的跟以前有些不一样了，比方说正方的门上以前装有玻璃，里面是雕花木刻，那个时候，玻璃要从香港运来，丫头们每天起来都要擦玻璃，现在新修的没有装玻璃。由此可见当年朱家的财力。