我倒着回答你的问题。
倒1、如果拆迁，肯定按照房产证面积补偿。
倒2、如果你回现在还没办房产证，答要初始办理，那房屋面积越大，你承担的契税肯定也就越高。
倒3、重新测绘基本不现实，因为你是单位套房，而房屋测绘需要计算公摊面积等，要重新测绘，则需要重新测绘整幢建筑的面积从而计算公摊，及计算你们一家的建筑面积。
倒4、办房产证是面积大点还是小点好。当然是大点，你办理抵押、买卖，都能赚。
最重要的一点就是原房屋是否已经办理过房产证，如果有办理过，一般以原证为准。
另外，房屋面积是感觉不出来的。各个地区对于房产面积的计算要求不同，甚至不同时间也会规定不同的计算方法。所以得出的面积与测绘人员不一致很正常。不要老觉得自己感觉总是对的，要相信房屋测绘人员的专业性。
我觉得你所谓的阳台可能只是晒台，而晒台是不计算面积的。
还有房屋的墙体也是只计算一半面积，外半墙整幢公摊等等，反正房屋面积的计算有很多的细则规定。