农民公寓没有房产证怎么证明房子是自己的

你的问题不清楚，农民公寓是什么性质？宅基地修建？拆迁安置？地方政府福利分配？或者本身就是违章建筑？ 情况说清楚才能回答。
什么手续和证明都没有在法律上就不能证明房子是你的。