玛瑙不是玉。请仔细参考以下几中物质的区别：
玉髓：
玉髓其实是一种石英，的隐晶质体的统称，它是石英（隐晶质）的变种。
SiO2，二氧化硅。我们在河边或海边常见的洁白的石头就是这个东东。。。
玛瑙：
玛瑙是玉髓类矿物的一种，经常是混有蛋白石和隐晶质石英的纹带状块体。
含有二氧化硅的溶液凝结成硅胶。含铁岩石的可熔成份进入硅胶，最后二氧化硅结晶为玛瑙。
玛瑙的主要成分为二氧化硅，由于与水化二氧化硅（硅酸）交替而常重复成层。
因其夹杂氧化金属，颜色可从极淡色以至暗色。用铁、钴、镍等盐类，任它们自然渗透于硅酸凝胶中，能人工制成"玛瑙"，天然玛瑙可能亦是在相似情形下生成的。
水晶：
水晶和玛瑙的化学成分都是二氧化硅，但二者还是有一些区别，水晶是单晶体，一块水晶通常是一个水晶晶体，而玛瑙则是多晶集合体。
关于单晶体和多晶体，可以百度以下，我化学不是很好。。。
玉：
在矿物学上玉分为硬玉（也称翡翠，主要成分为 NaAlSi2O6）和软玉（透闪石、阳起石一类，因化学成分的不同而呈现各种颜色，种类较多，但主要成份均为 Ca2(Mg, Fe)5Si8O22(OH)2）。。。
不同地方，不同地质条件的玉成分都有差别。。。
所谓玉的瑕疵，就是因为有其他的化学成分造成的。。。
玉的形成按先后可划分为如下几个重要时期：
一、白云岩沉积阶段
在中元古代晚期（距今约十几亿年），在塔里木古陆南缘，也就是今天昆仑山脉北缘所在的位置，曾经是一片浅海地带，那里有大量的碳酸盐沉积，其中含镁质的白云岩为成玉的主要物质来源之一。
二、白云岩区玉变质阶段
在元古代末期震旦纪，塔里木运动造成全区强烈的褶皱断裂活动，从而最终形成了塔里木大陆。在广泛的区域变质作用中，白云岩变质为白云石大理岩。此后，该地区的陆块隆起，成为我国最早露出海面的陆地之一，其上也没有原层沉积物覆盖。
三、白云岩交代蚀变阶段
在2亿多年前的古生代晚期的石炭纪晚期至二叠纪晚期，一次世界性的地壳运动发生了，被称为“华力西运动”。华力西晚期，在塔里木大陆的南缘，古陆块的陆缘地块和活动带中间地块中有强烈的断裂活动和岩浆活动，沿断裂带有中酸性侵入岩侵入白云石大理岩。在侵入体顶部残留的白云石大理岩捕掳体或舌状体与岩浆侵入体和热液接触交代后，形成透辉石化、镁橄榄石化和透闪石化蚀变，成为成玉的物质条件之一。
四、成玉阶段
华力西晚期侵入体派生的浅成中酸性岩脉侵入到白云石大理岩蚀变带时，再次发生接触交代作用，在适当的地质条件（300―350摄氏度左右，2.5千巴以下和一定的扭压应力）下，和阗玉最终形成。
也就是说，水晶是单晶硅，玛瑙石多晶硅夹杂氧化金属。玉是不同构造的硅酸盐。
翡翠：NaAlSi2O6，硅酸铝钠。。。它的矿物名称叫"钠辉石"。。
玛瑙和玉，说有联系吧，主要都是硅元素。都是结晶形成的。说不同吧，他们根本不是相同的物质。
说白了，任何东西都是化学元素构成的。只是形成的复杂度不同，或者普遍或者稀少。稀少的就物以稀为贵了。
希望能帮到你。。。