净水机首次使用应进行冲洗，以冲掉净水机内的保护液，方法如下：将自来水龙头、自来水进水球阀、净化水龙头全部打开，冲洗15分钟直到产水清澈无泡沫为止。冲洗过程中频繁的开关自来水龙头（关3秒、开10秒）使水流形成脉动式的冲击，会使冲洗效果更好。之后关闭排污水龙头，打开净化水龙头，制水5分钟后可正常使用。
经常顺冲洗：在日常使用自来水龙头取水的过程也就是对净水机进行了顺冲洗，建议在取用净化水后打开自来水龙头冲洗一下，及时将截留的污染物冲走，保持净水机较高的水通量，从而延长使用寿命。
反冲洗恢复产水量：如果净水机通过顺冲洗后产水量还比较小，则可以考虑对净水机进行反冲洗。净水机上一般有个反冲洗的按钮，可以实现水流反向冲洗，以冲掉滤芯中的堵塞物。
当超过三天不使用净水器，再次使用时应对净水器先顺冲洗2-5分钟，直到净水器内的存水排尽为止；
在自来水停水的情况下，请先打开排污水龙头将自来水管内的泥沙、铁锈等排尽后，再打开净化水龙头使用净水；
净水器发生故障时请立即关闭自来水进水阀，切断净水器的进水，请勿自行拆卸。、
只对滤芯进行更换的产品，并不能保证其外壳内壁、出水管路没有二次污染。不同净水产品滤芯更换周期也不一样，成本较低的PP棉每月须更换一次，活性炭则为三个月。
而除了更换滤芯之外，还需按时对出水管路等部件进行清洗和消毒，否则由设备造成的污染比没有处理的水还要大得多。因此购买质量合格的净水器产品尤其重要。