热水器进了一老鼠用透明胶封住底部和顶部的洞可以吗

可以。
只是既然老鼠已经进入到里面去了，封住热水器底部和顶部的洞口，顶多就是把老鼠饿死在热水器内部，且老鼠弄出来之前热水器没法正常使用。
所以还是建议想办法把老鼠赶出来，以免把热水器内部弄脏或者是搞坏。