我也经历过这个情来况。首先你不源必将上海的公积金账户取消，一般来说还款都有一张银行卡，你只要定期将还款金额汇入银行卡，会自动还款，仍按公积金的贷款进行利息计算，公积金只影响你申请购房子时的借款模式，对于已经贷款的，不会影响的。
其次，外在公积金要想存入上海账户，那你必须要与上海的公司有劳动合同，并且公司愿意在上海帮你缴纳公积金，一般情况下是很难操作的。
第三，外地开户的公积金只能在当地使用，现在国内的区域分割太厉害了，暂时还无法实现跨区域操作，因为各地的平均工资和缴纳基数不相同，所以区域差异是客观存在的，并且暂时无法调解。