水渠边是90度石头垒起来的我在半米处种了一棵树会破坏水渠吗

是有可能的。当树根增大后可能破坏石头墙的结构，这个与人行道上的树根增大后会破坏人行道地面砖类似。但是，不知道你种的是什么树，如果是果树一般长得很慢，而且长不大，这个破坏很小。