① 无水打包型：该厕所的核心由可生物降解膜制成的包装袋、机械装置和储便桶三部分组成。用厕者便后离开，牵引装置自动启动将排泄物打包、密封，防止臭味外泄。包装后的粪便由环卫部门收集送往粪便集中处理场处理，无害化。在厕所使用地不污染环境，不留下残留物，且无需水源。
② 免水生物处理制肥型：该厕所的核心是安装了一个生化反应器，反应器中有可定期补充的生物填料。滑入反应器的粪便通过微生物的作用而降解，反应过程产生的高温可以消灭各种病原菌。粪便发酵完成后变成主要成份是腐殖质的有机肥。这种肥料可以直装出售，也可以用于就地的绿化工程。 循环水冲洗厕所的水源取自于粪尿经过处理后获得的洁净水，有以下两种方式。
① 尿液单独处理
这种类型的生态厕所单独收集尿液，加入一种药剂去除异味后，回用于冲洗厕所。粪便被搅碎后变成纸浆状的东西，干燥后制成肥料还田，也可以作为普通垃圾进行填埋处理。国内蓝洁士生态厕所就是这种类型。日本也有类似的处理装置，它是通过特殊设计的粪尿分离装置完成粪尿的分离。尿液通过微生物作用，脱除氨氮和其它异味气体回用于冲厕，粪便采用生物处理后外运。
② 粪尿混合处理
这种类型是目前国内生态厕所的主流产品。通过环境工程的手段,利用微生物的新陈代谢作用和物理化学作用，完成对粪尿污染物的降解，最终转化为CO2 和水排入环境，同时再生出清洁的水供冲洗厕所使用或直接排放进入环境。