1、用途不同
玻璃胶主要是用于玻璃和窗框之间的密封、玻璃与玻璃之间的密封、窗框和墙体之间的密封、瓷砖之间的密封等等，其主要用途就是连接与密封，玻璃胶的密封效果比较好。
而结构胶主要是用在建造工程方面，是用于结构性粘接的工具，比如电视背景墙木架和瓷砖之间的连接、阳光房框架和玻璃之间的粘接，或者是玻璃和瓷砖之间的粘接，这些方面用结构胶你粘性更好。
2、种类和颜色不同
玻璃胶又分为酸性和中性玻璃胶，颜色也有很多种，常见的都是透明的玻璃胶，除此之外还有黑色、白色、古铜色、银灰色等等；结构胶主要分为高性能硅酮结构胶和中性透明结构胶，结构胶的颜色相对比较单一，基本都是黑色。
3、黏性和牢固性不同
如果说黏性和牢固性这方面的话，肯定是结构胶要更好，因为玻璃胶的主要用途是密封性比较好，虽然也有粘连的效果，但两种胶的用途基本不同，而且结构胶的价格一般都比玻璃胶要贵上一倍，所以大家可以根据自己的需求来选择用哪种胶。
参考资料来源：百度百科-玻璃胶
参考资料来源：百度百科-结构胶