区别如复下：
1.商住楼的制土地使用性质为综合用地，根据国家土地法规定，综合土地的使用权年限为50年，而普通住宅的使用年限一般是70年。
2.未来使用费用不确定。商住两用型住宅水、电、暖等使用费用都将采取商用价格。所以，对于购房者应该在购房时询问清楚。目前，开发商大多在前期开发中采取相应的补救措施，能按民用价格缴纳。
3.商住两用型住宅和普通住宅相关税费存在差异。普通住宅项目初次购买和未来转让时契税为1.5%，而50年产权的住宅，其契税按3%缴纳。
4.贷款条件的限制。购买商住两用型住宅大多不能申请公积金贷款，但是也有少数项目在开发商的努力下能够办到。另50年产权或者40年产权的住宅，如采用银行贷款的方式，只能得到五成或六成按揭。
5.对于普通住宅而言商住两用型住宅人防和消防建设标准较高，相对更为安全。