马桶的分类标准很多，可按类型、结构、安装方式、排污方向和使用人群来分类，不同类别的马桶有各自的优缺点，适合不同的家居情况。
按类型分为连体式&分体式
马桶选购连体式还是分体式主要是根据卫生间空间大小而定。分体式马桶较为传统，生产上是后期用螺丝和密封圈连接底座和水箱二层，所占空间较大，连接缝处容易藏污垢；连体式马桶较为现代高档，体形美观，选择丰富，一体成型。但价格相对贵一些。
按排污方向分为后排式&下排式
后排式也叫墙排式或横排式，根据字面意思可以得知其排污方向。后排式马桶选购时要考虑排污口中心离地面的高度，这个一般为180mm；下排式也叫地排式或竖排式，顾名思义，是指排污口在地面的马桶。下排式马桶选购要注意的是排污口中心点离墙的距离，排污口离墙距离分为400mm,305mm,200mm三种。其中北方市场对400mm坑距产品需求量较大。南方市场对305mm坑距产品需求量较大。
按下水方式分为冲落式&虹吸式
马桶选购要视乎排污方向。如果是后排式，要选购冲落式马桶，其借助水的冲力直接将污物排出。冲落式的排污口较大较深，借助冲洗水的冲力直接将污物排出，其缺点是冲水声音大。如果是下排式，应该选购虹吸式马桶。虹吸式细分有两种，包括喷射虹吸和漩涡虹吸。虹吸式马桶的原理是借冲洗水在排污管内形成虹吸作用，将污物排出，其排污口较小，使用起来噪音小，较为安静。缺点是用水量大，一般6升储存量一次用完