（1）根据规范精神，错层结构中，错开的楼层应各自参加结构整体计算，不应归并为一层计算。但各自独立计算的错层楼板不宜简单地按刚性楼板假定计算，特别是楼板被洞口切分成狭长板带时，应考虑楼板面内刚度消弱的影响。建议将这些楼板设定为弹性膜 ，用 SATWE 计算时选择总刚分析方法 ，将按两种模型定义的楼板的计算结果进行分析对比。
（2） 在没有楼板的区域可能存在大量的跃层向构件和不受梁板约束的自由节点，因此计算振型个数需要增多，以保证有效质量系数大于 0.9。
（3） 错层结构属于复杂多高层结构， 抗震计算时应选择考虑双向地震作用 ；如是高层错层结构，还应选择考虑偶然偏心 。新版 SATWE 程序允许同时选择以上两项，程序分别计算，取不利情况。
（4） 错层结构层高不一致， 使有关楼层间的控制参数，如层间位移比、层间刚度比、层间受剪承载力比等计算失真，因此不宜机械地直接采用这些数值，而应加以分析判断和手工校核调整， 确定其是否合理。
（5）SATWE 可自动搜索错层结构中的跃层柱及正确设定其计算长度系数，但内力和配筋只能按楼层分段描述，设计人员可取各段配筋中的最大值出图。
（6） 目前 SATWE 没有自动搜索分析短柱和矮墙的功能，需要设计人员手工对这些容易发生脆性破坏的构件采取特别的加强措施。
（7） 考虑到错层结构计算分析的复杂性和不确定性，除了用 SATWE 等软件进行常遇地震下的弹性计算以外，必要时还应采用 EPDA 程序进行弹塑性动力时程分析和 Pushover 弹塑性静力分析，以便对比验算及找出需要加强的薄弱部位。
（8）带转换层、加强层、连体、多塔等情况，或建筑各部分层数、结构布置或刚度等有较大不同的错层高层结构，即属于明显不规则的复杂高层建筑，根据建设部令第 111 号的精神，应进行专项审查，这是保证错层结构设计质量的重要措施。