砸卫生间的墙砖和地砖会破坏卫生间的防水吗

几乎是肯定的。你把地砖砸掉，并不只是砸地砖，而是要把地砖和粘贴地砖的水泥砂浆一起砸掉，而防水层就在水泥砂浆下面。
不知道你是想把整个地面的瓷砖全部砸掉，还是只是把凹处的瓷砖砸掉（如只砸凹处瓷砖，先买好瓷砖再砸）。砸完后做防水，蓄水实验24小时无渗漏再贴瓷砖即可。