根据上述职责，市住房和城乡建设局设16个内设机构：
（一）办公室
承担局机关文电、会务、接待、机要、档案等日常工作；承担局机关信息、保密、信访、安全、督查、建议提案办理、政务公开、后勤服务等工作。
（二）人事教育科
承担局机关及直属单位机构编制、干部人事、教育培训、考核奖惩、劳动工资、社会保险等工作；承担指导局系统专业技术人员执业资格注册管理工作；承担组织全市土建系列技术职称考试、呈报和职业技能岗位资格考核工作；承担局机关并指导直属单位离退休人员管理、服务工作。
（三）计划财务科
编制全市城市建设项目资金使用计划；会同有关部门拟订全市建设行业中长期规划和行业各项年度计划；承担局机关并指导监督直属单位财务和国有资产管理工作；承担监督、管理建设行业综合统计工作。
（四）政策法规科（加挂行政审批科牌子）
承担有关规范性文件的合法性审核工作；承担建设行业法律法规的咨询、清理、汇编工作；承担局系统普法宣传教育、行政执法监督工作；承担局机关行政复议和行政应诉工作；承担有关重大政策的调研和分析工作；承担建设工程施工许可证的审批工作；承担局系统行政审批事项的统一受理和回复工作。
（五）审计科
承担全市城市建设项目资金使用情况的审计工作；承担审核、审计市政建设工程预、决算的工作；承担局系统收费的监督管理工作；承担局机关及直属单位财务和经济责任的审计工作。
（六）住房政策科
拟订住房建设、住房制度改革、城镇住房社会化及商品化体系、中低收入家庭（人员）住房的政策、规定和措施；参与编制城镇住房建设中长期发展规划和年度开发计划工作；会同有关部门承担查处住房制度改革中的违纪、违规案件的有关工作；承担县市住房制度改革的指导、协调工作。
（七）建筑业管理科
拟订全市建筑业中长期规划和年度计划；承担房屋建筑和市政公用行业施工、监理、咨询、检验检测等企业的资质审核、报批和管理工作；承担施工企业出入境登记工作；承担指导工程定额、造价及劳保基金统筹管理工作；承担组织施工企业参与对外工程承包和劳务合作的工作；承担建设行业统计和建设活动中不良行为记录的综合、上报工作。
（八）工程建设管理科（加挂招商科牌子）
参与编制市政基础设施建设的中长期规划和年度计划；承担指导城市道路、桥梁、城市供水、节约用水、排水、污水处理、防洪排渍等设施设备及其附属设施的规划和建设工作；承担指导市重点工程项目建设的工作；承担城市建设招商引资工作。
（九）质量安全管理科
承担全市建设工程质量、安全生产的监督管理工作；承担组织建设工程竣工验收备案和综合验收的工作；承担建筑施工企业安全生产许可证审核、报批工作；承担局系统安全生产教育和安全监督管理工作；承担审核建设工程起重机械特种作业人员操作资格的工作;承担组织建设工程质量安全检查的工作，承担参与建筑工程质量安全事故的调查和处理工作。
（十）勘察设计管理科
拟订工程勘察设计咨询业改革方案、产业政策和规范性制度；承担监督实施各类设计标准执行的工作；承担全市勘察设计、施工图审查单位的资质审核报批和勘察设计注册人员的有关管理工作。
（十一）总工程师办公室
会同有关部门编制城市建设、市政基础设施建设发展规划；参与全市重大建设项目的技术论证等前期工作；承担重大工程质量安全事故原因分析和认证工作，参与重大工程质量安全事故抢救的现场指导；承担建设工程初步设计审批工作；承担指导施工图审查工作；参与城乡规划的编制工作。
（十二）公用事业管理科
拟订城市道路、供水、排水、燃气、污水处理等公用事业行业的发展规划和管理规范；承担城市供水方面的行政审批工作；承担城市排水许可证核发审批工作；承担供气等公用事业的特许经营管理工作；承担指导供气企业的管理和营运工作；承担全市供气企业资质的审核和审批工作；承担城市新建燃气企业和燃气设施改动审批工作。
（十三）建筑节能与科技科
拟订全市建筑节能、建设科技及工程建设地方标准化政策；承担组织实施市级以上建筑节能、科技重点项目和示范工程的工作；组织拟订局系统科技发展规划和计划；承担指导行业内科技成果鉴定和新技术、新工艺、新材料、新设备的推广、应用的工作；承担科技发展基金的管理和使用工作；承担组织实施重大建筑节能项目的工作；承担公共用房的建筑节能工作；承担建筑材料使用的监管工作。
（十四）小城镇建设管理科
参与编制全市小城镇建设发展规划和年度计划；承担指导小城镇综合开发和市政公用设施建设工作；承担编制全市小城镇建设资金计划的工作；参与小城镇建设重大项目的选址和定点工作；承担指导小城镇和村庄人居生态环境的改善工作；承担指导农村住房建设和危房改造工作；承担市小城镇建设领导小组办公室的日常工作。
（十五）执法稽查科
承担建筑市场、勘察设计和市政公用事业市场的专项整治和执法监察工作；承担查处建筑市场、勘察设计、市政公用事业行业违反有关法律、法规案件的工作；承担建筑施工合同备案管理工作；参与处理与建设活动有关的各类纠纷。
（十六）园区建设工程管理科
承担园区各项工程建设的管理工作；承担园区建设工程质量安全监督及工程竣工验收备案工作。
纪检（监察）机构和党群组织按有关规定和章程设置。