南京大学仙林校区位于南京市栖霞区仙林大道163号。
仙林校区将建设成为学专校主校区，属主要是理科应用学科、文科基础学科及工科。现仍处过渡阶段，有些院系尚未整体迁入，等仙林校区院系楼建成后，对应院系全体师生即可全部迁入。
仙林校区主要容纳人文学科、理工科应用学科和部分基础学科、高技术学科，以及主体在鼓楼校区的社会学科和部分理工科基础学科的一至三年级本科生教学。鼓楼校区主要作为社会学科、医科、部分理工科基础学科开展科学研究及四年级本科生和研究生教学的主要场所。浦口校区主要作为金陵学院、模式动物研究所等单位的教学和研究的主要场所。