这个问题在现行法律中，也是个非常难以解释的问题。
一般情况下，甲的所有权证被撤销，回归到原有状态，即原房主的名下，但和第三人乙签订的借款合同和抵押合同有效。因为乙是善意第三人的话，他可以信任行政机关依职权发放的房地产权证，所以基于这种信任，才会同意贷款，所以这个借款合同不应所有权的丧失而无效。乙可以向甲追索债权。
现在麻烦的问题是抵押合同的问题，产权回归到原房主的名下，要实现抵押权已经不切实际了，如果甲逃掉，那么乙的债权更得不到保障。如果原房主拿到产证发现还有抵押的负担，更可能提起行政诉讼，要求登记机关撤销抵押的负担。
现在一般的做法是抵押跟随房屋，登记机关不主动撤销。房主拿到产权证后，转让受到限制。
抵押权人只能通过债权的诉讼，然后凭借生效文书要求法院进行查封，这样，登记机关就不能主动将房屋归还到原产权人名下。说到底，只要乙逃掉，抵押权基本上没有可能实现了。所以银行在放贷时需谨慎啊，一定要注意现实情况的调查。