挑高小户型的房子抗震性能很差吗

从来没听说过抗震性能与层高有关。
这纯属谣传。
房屋的抗震性能，版是根据房屋的主权体结构性能决定的。简单的说是砖混，钢混，还是钢结构等。
现在房屋对于抗震级别有规范要求的，针对于不同项目，房屋的抗震级别也是可查的。
还有，南京属于冲积平原地区，本身的高级别地震的可能性从地质构造学来说就不大，不要想太多，太杞人忧天了。
至于你说的容积率和挑高户型的限制，这是为了限制开发商偷换概念，规范商品标准化。
至于层高1.5倍的计算，住宅应该是4.5米，而不是你所说的3.0米。（当然是我没记错的情况下）