各地的情况可能略有不同吧，按照我从业10年的经验回复如下：
买了商品房后，办理的产权专证包括国有土属地使用权证和房屋产权证书，土地证是有起止年限的（根据使用性质不同，出让年限从40年至70年不等），房产证是没有年限的（永久所有），至于你说的契证，我想应该就是交纳契税的凭证吧，我们这不用单独办理，交了税后税务局会开具契税发票。但契税规定是买房交纳，这是办理房屋产权的必要条件。如果你交纳了契税，就应该给你这个相应的票据或证明，视你们本地的规定而定。反正我这里只是给契税发票就好了。
如果你的项目真是统一报建，分期开发的，那么开发商说的有可能是真的，在项目未全部竣工前，无法确认最终实际建设的总建筑面积，那么无法根据建筑面积对土地进行分摊到每套房产，有可能因此暂不能办，但你们本地的情况我不是特别清楚，建议你就这个情况去你们当地的房产局市场科了解或投诉。
希望能帮到你，并得到你的采纳，谢谢