红木在保管过程中应该没有产生虫害、菌腐，以及未因干燥应力变形而发生的严重开裂。所以木材在运输和生产存放环节的工作是十分重要的。木材的保护工作根据运输、生产存放阶段以及原木和板材类型的不同，采取的措施类型也不同。常用木材的保护方法分水保存，湿保存，干保存，化学保存等。采取正确的保护措施不仅能保护木材的品质，提高木材的价值和利用率，还能促进后续木材干燥速度和干燥质量的提高。
一、红木木材的保存与保护
1、水保存：水保存法在常规的木材加工企业和胶合板生产企业运用较多，但在现代红木加工企业运用极少。很多红木加工生产企业在材料处理时，增加了红木木材水煮工序，如果企业有水煮生产工序可以采用水保存法存放木材。
水保存法是将木材存放在河道、河泊等水流速度低而平缓的区域，或将原木存放在水池中，使木材表面水分呈饱和状态，可预防干裂，同时也可以防止菌类侵害，因木材含水率高则氧气的含量低，变色菌和腐朽菌难以生存，一般蛀虫也不易产生。将原木完全浸泡于水中，是最有效的保护方法。此方法在我国前期传统的红木家具生产就已经有使用，通常将木材存放在水中达到数月之久，待木材表面树皮腐烂、脱落后才进行后续的加工工序。
将木材存放在河道、河泊等水流速度低而平缓的区域储存木材方法，比较适合水运原木大批量到材的储存，红木生产企业规模比较小，可以将原木储存在水池中保存，该方法管理费用较低，由于红木原木有的是漂浮的，不能完全浸入水中，结果露出水面的部分肯定发生开裂、变色或腐朽。对漂浮的原木也可以经常翻动，保持木材处于全湿状态。也可采用喷水的方法，保持木材处于全湿状态。
2、湿存法：将原木存放在地势较高的水泥地面上，用压力泵给水加压喷头不间断地向原木表面喷水，使木材表面保持全湿状态，这样也能获得良好的效果。该方法对投资和管理费用低，对地点要求和储存量富有弹性。
3、干存法：该方法适合原木和板材的保存，将原木或板材存放在通风的室内或有顶棚的场地，采取自然通风保存。堆放木材板方材时最好将每层木材用木条将其隔开。不仅能很好地保存木材，还可以起到促干作用。该方法投入成本低，管理费用低。但如果保管不当或在保管过程中不处理木材的端头和表面，容易产生开裂等质量问题。为了减少木材在保管过程中的质量损失，还要采取以下措施：
木材端封：由于木材端部的气干速度较快，所有的木材在储存或干燥过程中都会发生某种程度的端裂。若在造材或制材之后，立即以特质端部防裂漆将材端涂封，可防止端裂发生。材端涂封多用于高价值的木材以求经济。比重大的木材较容易发生端裂与劈裂，同时，干裂的程度会随着木材直径的增大而增大。有时需将半干木材的端裂部分切除再涂封。否则在干存或窑干时木材会沿着原有的裂痕继续加深加宽，进而失去材端涂封的意义。材端防裂漆也有预防菌虫害的作用。
材端防裂漆依据涂布温度（冷涂或热涂）或化学成分（沥青化合物、蜡剂、蜡乳剂、调和漆）分类。不同的防裂漆随温度、涂布方法（喷涂、刷涂）附着力、涂刷次数、柔韧性、抗水性，以及对加工等情况而有所不同，其特性说明书有记录。白铅粉与煮沸的亚麻籽油所制成的糊状防裂漆效果很好，适用范围广，抗水性好，附着力强。从原木到制品的储存到干燥均可以使用。
4.预冷冻处理：根据有关试验，生材预冻处理后再干燥不仅可以增加干燥速度，降低木材的收缩率，还可以消除难干木材的干燥内裂和溃陷。冷冻处理最低试验温度为-26～-140℃，冷冻时间随板材厚度和冷冻方法不同而不同。最短的为几个小时，一般在10～24小时。预冻有良好的效果，但是成本很高，主要是在科研和试验室内研究，在运用木材加工生产方面目前媒体还没有报道。
5.化学处理：化学处理用于尺寸大容易开裂的木材，窑干前以吸湿性化学物质处理木材表面，使其表层吸收水分并保持润湿，可以减缓表面水分蒸发的速度，从而减少干燥含水率梯度和干燥应力。防止干裂产生，因而可以提高干燥速度。
常用的吸湿剂有普通食盐、尿素、二甘醇等，处理方法是以上药剂的水溶液浸泡或喷涂在木材表面，或将药剂干粉喷洒于木材表面。再密实堆放一段时间，使药剂渗入木材表层后再干燥。
化学处理的缺点是在干燥木材的表层有残留的化学物质，通常会减弱木材的强度，影响胶合性能，以及加速铁钉或金属连接件的腐蚀。因此在决定处理前应考虑得失关系。
三、其他保护措施
保护木材的质量应当从生产的源头开始。减少木材变质损失的方法有：砍伐木材后快速将原木锯制成制品，并立即堆放通风气干；但事实上很难做到，制材后若不能及时干燥，一至两周内就发生青变并迅速蔓延，有的化学变色，即使能迅速堆放，也不能消除，如棕变。所以木材砍伐后立即进行防开裂和防变色处理是最有效的措施。
在北方的冬季是木材砍伐的季节，当空气温度接近零度时，无论何种木材，很少发生开裂，很少产生变色或菌腐。所以在温带地区的冬季，不必担心木材在储存过程中会产生开裂或菌腐，如果环境温度超过10℃，砍伐后木材在储存过程中就会出现端裂、变色或菌腐，热带和亚热带地区应特别注意。实际生产中企业如果能建立小型的冷藏库将木材存放其中，就可以减少木材的端裂、变色或菌腐，还可以提高木材的干燥速度。
木材砍伐后菌类引起的变色一般发生在边材，通常称为边材变色，而边材变色中有以蓝变最常见，有称之为青变或蓝变，蓝变对木材外观有影响，对机械强度影响甚少，然而褐腐朽可同时危害边材与心材，并严重影响木材的强度。引起红木木材的变色和腐朽的因素目前研究较少，所以从源头做起十分必要。