由于日式庭院强调自然元素比较多，而且非常注重细节方面的处理，所以我们会看到日式庭院当中是最贴近自然的，但仔细观察的时候又发现细节方面的处理与自然景观不太一样，反而有点接近禅宗，这就是日式庭院设计的核心思想，既贴近自然又贴近禅宗，让人们在自然的环境当中更加舒畅一些，而且在体验舒畅的过程当中，又可以参禅悟道。那么想要设计好日式庭院的话，我们必须要注意以下几个元素：
1、岩石和沙硕
在大部分日式庭院的设计过程当中，总是少不了岩石和沙硕的，因为日本人特别喜欢大山在大山面前，人是非常容易顿悟的，所以日本人就喜欢把岩石和沙漠加入到日式庭院设计的基本几个元素之中，因此我们对于岩石和沙硕的选择一定要有自己的想法，可以根据自己的想法提出一些组合方案来，然后从组合方案当中选择出自己最喜欢的一个。
2、草坪和苔藓
另外我们还需要注意的是，草坪和苔藓也是日式庭院设计元素当中比较重要的元素之一，因为草坪非常贴近大自然，经常与大自然结合融为一体，而苔藓更是日本人喜欢的一种植物，因为这种植物无论在多么恶劣的环境下，都可以顽强地生存。
3、小桥和流水
这个元素就有点贴近日本人的日常生活了，因为很多日本人除了参禅悟道之外，对于本身的日常生活也是非常重视的，这一点有可能是受我们早期的中国人影响，因为在大堂时候我们中国人的大部分设计元素都有小桥和流水，所以当时的日本人就在中国学习到了很多类似这样的元素到自己的国家，只不过在寸土寸金的日本来说，可能有小桥和流水是比较奢侈的。