砖混结构墙体砌筑之前预埋竖向管线是正确的，砌筑时，埋管处的转一般要版挑选或权略作处理，以使墙体薄弱断面尽可能小。你说的灰较大既可能是灰浆饱满，这是好事，可使埋管引起的断面减小得到加强。过去曾有施工单位砌后剔槽，这会产生振动，对已完工的砌体不利。现在装修施工时增加或改动管线也这么做，但这是因为建筑设计和专修设计未同步进行，无法做协调，没办法只好剔凿。据说国外极少有毛坯房售，都是装修和建筑整体设计，统一施工，这就避免了剔凿。
在砖墙上 横向（水平向）埋管是不允许的，电线管水平向布置都是在楼板内埋管，而侧砌砖（立砖）在承重墙体的任何部位都不允许。
和施工方好好协商解决是最好办法。监理应当了解相关规定，可请监理处理，这是正常途径。如果不能解决，可请教当地质量监督局（站），对明显不符规范、规程的现象，他们肯定会管。