长江中下游湿地将通过退田还林、还湖、还泽、还滩、还草及水土保持等措施，内使长容江中下游湖泊湿地的面积逐渐恢复到原有水平，改善湿地生态环境状况。规划确定，将充分发挥该区域湿地以调蓄为主的生 态功能，在长江中下游湖群区建立湿地保护和合理利用模式，确保这些湿地区域资源、环境和经济的可持续发展。在水质污染严重的湖泊开展污染防治和生态环境的治理，使之逐步恢复原有的生态环境质量。
规划还提出，要全面评估该区域的一些国际重要湿地的保护状况，加强保护区建设，尤其是只有国际重要意义的水禽栖息地建设，使该区域丰富的湿地生物多样性得到有效保护。
此外，这一规划还对东北湿地区、黄河中下游湿地区、滨海湿地区、东南华南湿地区、云贵高原湿地区、西北干旱湿地区以及青藏高寒湿地区提出了各自的分区建设规划。