特别会计预算是分类管理型事业预算。它包括五大类:
（1）事业特别会计预算。它是指经营特定事业的预算，如邮政事业特别会计预算，道路建设特别会计预算等。
（2）管理特别会计预算。它是由1956年之前的贸易特别会计转化而来的，是指从事特定产品、业务管理或调节供求关系的特别预算，如粮食管理和外汇资金特别会计预算等。
（3）保险特别会计预算。它是指管理政府社会保险业务的特别会计预算。
（4）融资特别会计预算。它是指管理中央政府融资贷款的特别预算。
（5）整理特别会计预算。它是指管理中央政府特殊资金的特别会计预算，如国债偿还基金特别会计预算等。 需要指出的是，上述日本特别会计预算采用的是《国家预算》（大藏省主计局财政调查会编辑）最初的分类方法。特别会计分类，不一定限于五类，依据各种标准，可有各种分类方法。例如，还可以将特别会计分为三类:
（1）国家为兴办特定的事业。
（2）国家为运用持有的特定资金。
（3）国家经营的区别于一般岁入岁出的，以特定岁入充当特定岁出。
政府关联机构预算，是指各政府关联机构的财务预算。政府关联机构，是指依据法律设立的、中央政府提供全部资本金的法人，是经营事业、尤其是融资性业务的机构。如日本进出口银行、日本开发银行、中小企业金融公库等。