第三方检测机构的费用谁来出

这个，肯定是合同约定的。

现在发生争议，只能再定一个补充协议了内。否则就只能容咬文嚼字地看原合同的规定。

检测收费当然原则上应以项目为单位计算，同时兼顾上门检验次数。具体要视检验内容而定，要合理科学并双方都可以接受。