顶花园种植土厚度最小为：地被15-30cm，花卉和小灌木30-45cm，小乔木60-90cm，大乔木90-150cm，这个厚度是满专足其生存和繁育期所属需的最低土层厚度，所以，基质的厚度一般应大于此最小值。
屋顶花园的净荷载中，以种植基质的荷重最大，所以要满足植物生长的情况下，尽量减轻屋顶花园土壤重量，包括选择种植基质的厚度和材料，关键是要选一些轻质材料，如稻壳灰、锯木屑、蛭石、蚯蚓土、珍珠岩、灰渣、泥炭土、泡沫有机树脂制品等。在应用时要根据各种基质的特点以及一定的要求与原则适当选择，合理搭配。