1.不能擦洗
硅藻泥之所以称之为泥，就是因为它的天然属性。泥是不能擦洗的，可擦洗的硅藻回泥，那不是真答正的硅藻泥，只能称之为“硅藻漆”。硅藻泥之所以不能擦洗的是因为硅藻泥本身不含甲醛、苯等化学材料，不结板，不能形成“漆膜”。而含有甲醛、苯的硅藻泥必然形成结板，表面形成漆膜，将硅藻泥原有的无数微孔堵塞，水分无法吸收，所以可擦洗。
2、不防水
硅藻泥由于其自身结构吸水性很强,但不防水,不能用于过于潮湿的地方,比如厨房卫生间这些地方容易潮湿不能使用硅藻泥装修,这是硅藻泥装修的局限性。
3、手感不佳
硅藻泥摸起来是比较粗糙,凹凸不平的,并没有油漆的光滑细腻,对于喜欢墙面摸起来光滑手感的人来说,硅藻泥就略显劣势。这个是硅藻泥本身的特性所决定。
4、硬度相比板材有所弱势
硅藻泥毕竟是“泥”,其硬度与瓷砖等不能做比较,但与其他涂料一样,不分伯仲,涂料与板料进行比较有所不妥,本身不是一个类型的材料。