三层违建房被邻居恶意投诉怎么办前提是对他没有造成影响的

1、农村违章建设也受规划建设部门管理，你可以举报，规划建设部门会责令其停工建设版、限期拆除等措权施，期满不拆除可以予以强制拆除（这点随着行政强制法的出台及法院的司法解释，现在实践执行中有争议）；
2、违章建设对你的房屋造成损坏，你可以起诉要求排除妨碍、赔偿损失，至于标准可以在诉讼时申请鉴定，在法院的主持下双方共同选定鉴定机构或者由法院指定，以鉴定报告为准。